Ставрополье достаточно футбольный регион с богатой историей. Согласно официальной статистике, профессиональный футбол в городе Ставрополь появился в 1912 году, о чем говорит появление первой настоящей футбольной команды, носившей не очень оригинальное название «Спорт». Постепенно, с каждым годом, число футбольных клубов в Ставрополе росло, как грибы после дождя, и после Октябрьской революции их было уже более десятка. Безоговорочным фаворитом считался клуб под названием «Рапид», за который играло несколько легионеров из Румынии, Италии, Венгрии, Германии – это были рабочие заводов и артелей.
Дело спорилось, и руководство города решило открыть свою футбольную лигу, поскольку желающих играть в футбол было очень много. Новый толчок в развитии ставропольского футбола дала Северо-Кавказская футбольная олимпиада. В 1924 году был образован СССР, и в этом же году появилась в Ставрополе футбольная команда под названием «Динамо», относящаяся к Всесоюзному обществу «Динамо», которое объединяло спортивные структуры силовых ведомств молодой страны. Через несколько лет «Динамо» становится лидером Ставрополя, это стало возможным благодаря тому, что руководство клуба разрешило играть в нем не только игрокам своего ведомства. Лучшие игроки «Рапида» вскоре уже надели футболки «Динамо», и команда стала в 1939 году лучшей командой Ставрополя.
В 1945 году команда первенствует на соревнованиях Россовета общества «Динамо», и уже в следующем году состоялся дебют динамовцев в первенстве СССР по футболу. Динамовцы не стали откладывать в долгий ящик поход за успехом, и в 1949 году берут звание чемпионов РСФСР, этот успех является самым весомым в истории клуба.
После распада СССР, Динамо получает место в высшей лиге чемпионата России, и в сезоне 1992 года занимает 15 место, а в следующем году поднимается на 12 строчку, но в сезоне 1994 году опускается на предпоследнее место и покидает высший российский дивизион.
В настоящее время Динамо Ставрополь выступает в группе «Юг» первенства ПФЛ. Тренирует команду Паата Беришвили, главным спонсором является «Газпром трансгаз» и «Русфонд».